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陕西师范大学学报(自然科学版)
生命科学
东亚三角涡虫新基因Dj_UF-1功能分析
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王立飞, 孙燕*, 刘清梅, 李治
(陝西师范大学 生命科学学院, 陕西 西安 710062)
王立飞,男,硕士研究生,主要研究方向为分子微生物. E-mail:WLF1213fred@163.com.
摘要:
为进一步完善东亚三角涡虫(Dujesia japonica)基因数据信息,对东亚三角涡虫新基因Dj_UF-1进行生物信息学分析和表达水平检测. 分析结果显示,该基因包含450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,Dj_UF-1蛋白分子量为17 179.8 D,等电点为8.03. 蛋白质三级结构预测发现Dj_UF-1与LYNX 1相似度较高. 实时定量PCR结果表明,Dj_UF-1基因在东亚三角涡虫头部的表达量高于其在尾部的表达量. 推测Dj_UF-1基因是东亚三角涡虫神经系统相关基因,Dj_UF-1为类LYNX 1蛋白.
关键词:
东亚三角涡虫; 烟碱型乙酰胆碱受体调节剂; 神经发育; LYNX 1
收稿日期:
2013-01-27
中图分类号:
Q71
文献标识码:
文章编号:
1672-4291(2013)04-0067-06
基金项目:
陕西省自然科学基础研究计划项目(SJ08-ZT08,2009JQ3002); 中央高校基本科研业务费专项资金项目(GK200902030,GK200902031).
Doi:
Functional analysis of novel gene Dj_UF-1 in Dujesia japonica
WANG Li-fei, SUN Yan*, LIU Qing-mei, LI Zhi
(College of Life Science, Shaanxi Normal University, Xi′an 710062, Shaanxi, China)
Abstract:
An unknown function gene Dj_UF-1 in Dujesia japonica was analyzed and predicted by the tools of bioinformatics, and the expression level of Dj_UF-1 in Dujesia japonica was detected by Real-time PCR. The results show that Dj_UF-1 contains an ORF with 450 base pairs and encodes a polypeptide with 149 residues predictedly molecular weight about 17179.8 D and pI 8.03. Protein tertiary structure prediction was found that Dj_UF-1 has high similarity with LYNX 1. The expression of Dj_UF-1 gene in different body part indicated that Dj_UF-1 is highly expressed in the head. These data demonstrate that Dj_UF-1 may be the LYNX 1-like protein and Dj_UF-1 gene may play a critical role in nervous system of Dujesia japonica.
KeyWords:
Dujesia japonica; nicotinic acetylcholine receptor regulator; neurogenesis; LYNX 1